Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM1Q8TC05 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms