Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATL2Q8NHH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms