Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RDM1Q8NG50 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RDM1Q8NG50 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms