Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC148Q8NFR7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC148Q8NFR7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms