Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP35Q8NFH5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP35Q8NFH5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms