Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC44A5Q8NCS7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC44A5Q8NCS7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms