Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX3Q8N9I9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms