Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR7Q8N806 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms