Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSGALNACT2Q8N6G5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms