Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC24Q8N4L8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC24Q8N4L8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC24Q8N4L8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms