Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASGEF1CQ8N431 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1CQ8N431 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms