Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME8Q8N427 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms