Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHTF2Q8N3S3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms