Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP4Q8N3C7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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CLIP4Q8N3C7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CLIP4Q8N3C7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CLIP4Q8N3C7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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CLIP4Q8N3C7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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CLIP4Q8N3C7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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