Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMTC2Q8N394 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMTC2Q8N394 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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