Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMNTD2Q8IXW0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LMNTD2Q8IXW0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms