Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGDCC3Q8IVU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms