Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC50Q8IVM0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC50Q8IVM0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC50Q8IVM0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms