Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPFIBP1Q86W92 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms