Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM3Q86VH5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM3Q86VH5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms