Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PBRM1Q86U86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PBRM1Q86U86 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PBRM1Q86U86 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms