Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLNKQ7Z7G1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms