Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2Q1Q7Z7E8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2Q1Q7Z7E8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2Q1Q7Z7E8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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