Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C16orf62Q7Z3J2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C16orf62Q7Z3J2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms