Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NIPA1Q7RTP0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA1Q7RTP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA1Q7RTP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms