Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2AFVQ71UI9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2AFVQ71UI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms