Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMIM5Q71RC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMIM5Q71RC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms