Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q71RC1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q71RC1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q71RC1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q71RC1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q71RC1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q71RC1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms