Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PREX2Q70Z35 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PREX2Q70Z35 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PREX2Q70Z35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PREX2Q70Z35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PREX2Q70Z35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PREX2Q70Z35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
PREX2Q70Z35 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
PREX2Q70Z35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
PREX2Q70Z35 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms