Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBR3Q6ZT12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
UBR3Q6ZT12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms