Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC73Q6ZRK6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC73Q6ZRK6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms