Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXD4L3Q6VB84 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms