Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP12Q6UXS9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP12Q6UXS9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms