Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO3Q6UWJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCO3Q6UWJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms