Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCIMPQ6UWF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCIMPQ6UWF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCIMPQ6UWF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms