Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC1Q6TDU7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASC1Q6TDU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASC1Q6TDU7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms