Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHC4Q6S5L8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC4Q6S5L8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC4Q6S5L8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms