Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNIP4Q6PIL6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP4Q6PIL6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP4Q6PIL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNIP4Q6PIL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms