Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM88Q6PEY1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms