Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ETFRF1Q6IPR1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ETFRF1Q6IPR1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms