Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CARMIL2Q6F5E8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CARMIL2Q6F5E8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms