Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD16Q68DU8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD16Q68DU8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms