Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN13Q68D06 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN13Q68D06 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLFN13Q68D06 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms