Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF123Q5XPI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms