Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL1Q5VZK9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL1Q5VZK9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CARMIL1Q5VZK9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms