Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUSD4Q5VX71 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUSD4Q5VX71 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms