Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BROXQ5VW32 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BROXQ5VW32 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BROXQ5VW32 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms