Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRCH2Q5VUJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms