Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C12orf60Q5U649 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C12orf60Q5U649 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms