Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SOGA3Q5TF21 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SOGA3Q5TF21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms